По окончании богатой футбольной карьеры, в ходе которой он провел более 500 матчей на профессиональном уровне, включая 38 встреч за «красных дьяволов» и, в частности, выступил на Чемпионате мира 98 года, проходившем во Франции, Филипп Клеман в 2011 году занялся тренерской деятельностью. Летом 2017 года он был назначен главным тренером "Ваасленд-Беверена", где быстро сделал себе имя в бельгийском чемпионате. В скором времени его работа была замечена в «Генке», который заключил с наставником контракт. Спустя всего 18 месяцев после своего назначения ему удалось привести «Генк» у золотым медалям чемпионата Бельгии. Следующим летом Филипп Клеман возглавил «Брюгге», в составе которого он позволил раскрыться ряду молодых футболистов, дважды подряд был признан лучшим тренером страны, а также одержал победу в Супер Кубке Бельгии.