Después de formarse como jugador de fútbol de salón, el nativo de Sarcelles hizo su debut en la Ligue 1 bajo los colores del Toulouse FC, durante la temporada 2010/2011. Después de una temporada de adaptación, se convirtió en el líder futbolístico y goleador del Toulouse, con 70 goles en 169 juegos y cuatro temporadas (2012/2013 a 2015/2016). Transferido al Sevilla FC en el verano de 2016, el delantero jugó tres temporadas completas con el club andaluz y debutó en las competencias europeas en las que mostró sus cualidades de goleador, con 22 tantos en 29 juegos. Tres años más tarde se convirtió en el cuarto mejor anotador en la historia del club sevillano (70 goles en 138 partidos). El 14 de agosto de 2019, Wissam Ben Yedder firmó un contrato por cinco temporadas con AS Monaco.