Samuel Nibombé rejoint le Club de la Principauté en provenance du Sporting Charleroi, où il a évolué durant la saison 2022-2023 avec la catégorie U18. Ses performances ont permis au natif de Mons d’être régulièrement appelé avec les sélections de jeunes de la Belgique. Tant bien avec les U15, les U16 et les U17 des Diables Rouges, Samuel Nibombé cumule, principalement en tant que capitaine, plus d’une vingtaine de rencontres, dont 10 sans concéder le moindre but. Après une saison 2023-2024 complète avec les U19 de l'AS Monaco, où il dispute 19 matchs pour deux buts, Samuel Nibombé intègre le Groupe Elite lors de l'intersaison 2024-2025. Le défenseur central sort d'un exercice réussit au cours duquel il dispute notamment la Premier League International Cup (PLIC), le Challenge Espoirs et la Youth League, participant notamment à 6 des 7 rencontres disputées par les Rouge et Blanc. Désormais lié au Club jusqu'en 2027, le capitaine U18 des Diables Rouges a également connu trois apparitions dans le groupe professionnel d'Adi Hütter, lors des rencontres de Ligue des Champions face à Bologne et Arsenal, et en Ligue 1 face à Angers. Il dispute ainsi ses premières minutes le 25 février 2026 en Ligue des Champions sur la pelouse du PSG, avant d'effectuer sa première en championnat seulement trois jours plus tard contre Angers.
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